حصل البروفيسور مجدى يعقوب على جائزة الشيخ زايد للأخوة الإنسانية، حيث أعلنت جائزة الشيخ زايد للأخوة الإنسانية عن أربعة فائزين، ومن أبرزهم البروفيسورالدكتور مجدي يعقوب