يخضع برنامج الأغذية العالمي لإدارة المجلس التنفيذي للبرنامج والذي يتألف من 36 بلداً عضواً ويتولى تقديم الدعم للمنظمات الحكومية الدولية كما يتولى الإدارة والإشراف على أنشطة البرنامج.