تنفذ الهيئة المصرية العامة لمشروعات الصرف التابعة لوزارة الري ،العديد من المشروعات العامة لخدمة المنظومة المائية ومن أبرز تلك المشروعات إنشاء شبكات الصرف المغطى و البرنامج القومي الثالث للصرف .